宝德服务器: 应用于中国疾病预防！宝德HPC集群系统

宝德HPC大型机群系统在生物医疗行业有着良好的口碑，宝德以其先进的技术，稳定的表现，实惠的性价比赢得一批又一批用户。宝德科技在HPC领域一直与Intel在技术的后端有深层次的合作，2004年3月建设了基于Intel IA架构为计算节点的宝德HPC实验室，为学校及学术单位的科研工作提供先进、稳定、有效、可靠、经济的计算工具平台，测试和演示的环境。

传染病预防控制所是中国疾病预防控制中心领导下的国家级传染病预防控制专业机构，是全国传染病预防控制业务技术指导中心。长期以来，传染病所缺少一套可用于高性能计算的集群系统，使其在基因分析等业务运行方面受到较大限制；与同行业的院所相比有一定差距。

因此传染病所决定构建一套生物信息计算集群，为其下属各实验室提供一个统一计算平台，提高计算机应用和管理水平。

用户需求：
传染病预防控制所需要该集群系统能够承担大规模运算任务，包括序列的多重比对、系统发育学研究、细菌全基因组序列分析、生物信息学综合分析等。

方案描述：
宝德科技根据客户要求，推荐基于四核至强®服务器的POWER Cluster8000 HPC系统解决方案，宝德POWER Cluster8000 HPC系统分层次设计，按照高性能计算生态系统部署，自上而下，包括HPC并行应用程序、中间件集群管理、通信库以及各类软件优化工具、操作系统、计算节点和主控节点的硬件平台、互联网络系统等。方案具有开放性、可扩展、性价比高的特点，满足传染病所的的应用需求。

依照初步草案，宝德科技与华大基因、照生软件与客户进行了多次交流，向客户详细介绍了方案中的种种优点，突出了宝德产品的优势，获得了客户的赞同。在这个过程中，华大基因项目的成功有很大帮助，因为有华大基因项目的经验，流行病所对宝德科技的能力表示认可。

其中管理节点服务器采用宝德PR2700服务器，存储节点采用PR3015S，计算节点采用宝德PR1760T高密度计算服务器。宝德“双子星”系列1U服务器PR1760T，是一款高计算密度的机架式服务器，主要特点是节省空间，倍增集成能力、将原先两台1U机架式产品，集成到1U空间内；相当于两台服务器集成，可以独立控制和管理、运行。整机提供4个集成网卡。并提供网卡冗余、散热风扇冗余能力，保证系统真正高可用。提升电源使用效率达到90％以上，满足系统高可用。极强性价比、领先的性能/U水平，高集成度设计，性能价格比相比普通机架式服务器提升一倍，同时在有限的1U空间内提供业界最强大的性能表现；独立控制，高稳定、高可用。

技术亮点：

宝德服务器均基于Intel IA架构，配合新一代四核处理器，前端总线（FSB）最高可达1333MHz，采用S5000P芯片组，双独立总线，数据带宽最高可达21GB/s。同时，融合Hyper Threading技术，最大限度利用处理器处理进程。

   宝德IA服务器具有以下几个鲜明的特点：
   ◎可伸缩性（Scalability），当服务的负载增长时，系统可被扩展来满足需求，且不降低服务质量。
   ◎高可用性（Availability），尽管部分硬件和软件会发生故障，整个系统的服务必须是每天24小时每星期7天可用的。
   ◎可管理性（Manageability），整个系统可能在物理上很大，但应该容易管理。
   ◎价格合理(Cost-effectiveness)，整个系统实现是经济的、易支付的。

系统拓扑：

系统配置：

商业价值：
本次采用INTEL架构服务器搭建的管理信息系统，充分体现了领先一代的Intel IA平台从研发到制造工艺，Intel积累了近二十年的技术结晶，厚积薄发，为高性能计算研究领域提供最好的计算平台。疾病所计算集群项目与华大基因项目类似，成功实施此项目将进一步扩大公司在生物、基因领域的影响。

经验收获：
疾病所在全国还有11家类似的研究机构，在不远的将来很多都需要使用一套类似的计算信息系统；做好这个项目有着标志性的意义。其他所可以对集群使用有一个直观印象，参照流行病所的使用经验构建自己的计算集群。

（新闻稿 2008－06－19）